Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功似乎地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2021-12-13 04:10:30 来源:
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已对,一项刊登在全球性杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究成果报告中都,来自欧洲地区遗传学研究团队等行政部门的化学家们通过研究成果将人类文明肠胃动物细胞分组中都所有已知的菌株基因分组编著成了一个大型的数据库,从而就能鼓励研究成果执法人员熟悉即使菌株基因和复合物之间的关联,以及其对人类文明身心健康的影响。

菌株遍布生理内外,其能够转化成复合物质来影响机体消化、身心健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于生理动物细胞分组成员的量要比生理细胞还要多,最主要菌株、真菌和其它动物细胞;为了解读菌株在人类文明生物学中都所扮演的最重要角色,化学家们通常则会在研究团队中都受控并对其培养,随后在对菌株同步进行DNA基因组,然而现今很多菌株还无法在研究团队的环境污染中都被培养繁殖。

为了获得这些菌株的相关信息,研究成果执法人员采取了另外一种方法,他们从环境污染中都(比如肠胃)搜集举例来说取样,随后在对整个取样中都的DNA同步进行基因组,然后利用计算机方法对来自举例来说取样中都的数千种亚种的生殖基因分组同步进行修缮,这种方法被称之为昌基因分组学技术,该技术能作为一种替代方法对单个亚种的DNA同步进行受控和基因组。

研究成果者Rob Finn暗示,去年最主要我们在内的三个独立制作团队修缮了数以万计个肠胃动物细胞分组基因分组,而最大者的最重要问题就是这些制作团队所给予的结果究竟具备可比性,以及究竟能将这些结果编著视作一个相当年底的清单。现今研究成果执法人员已经从人类文明肠胃中都超过4600种菌株群落中都编著了20万个基因分组和1.7亿个复合物质序列,这种新型的数据库(确立的人类文明胃肠胃基因分组集合和确立的胃肠胃复合物质参考资料)揭示了机体肠胃的极大社则会性,并为进一步同步进行肠胃动物细胞分组研究成果先驱者了道路。

研究成果者绘制显露的这个极大的参考资料是动物细胞分组研究成果的一个历史性,愿景或将能为化学家们缺少相当宝贵的自然资源来研究成果人类文明肠胃自然环境中都每一种菌株所扮演的最重要角色。这项研究成果表明,超过70%被检查到的菌株从而在研究团队中都被获得成功培养过,而其在体内的活性几乎未知,而这类菌株中都最大者的族群就是Comantemales;研究成果者暗示,看到Comantemales如此较广真是一个开心,这就凸显了我们的确对肠胃中都的菌株相符合,我愿意这个参考资料能鼓励生物信息学家和遗传学家在愿景几年毕竟这一知识空白。

该数据库/参考资料搜集的所有数据都能在在线自然资源Mgnify中都获得,其能鼓励化学家们分析方法动物细胞的基因分组数据并且与理论上的数据库同步进行对比;随着世界各地研究成果制作团队大幅度发布新的数据库,该参考资料可能则会扩大到最主要其它机体口部的动物细胞分组,比如皮肤或口腔之外等口部。就此研究成果者暗示,这一参考资料的编著愿景或为动物细胞学家和临床研究成果执法人员缺少多样的自然资源,然而研究成果执法人员可能则会在南美洲、东亚地区和南部非洲等代表性过剩的地区发现更是多新的菌株亚种,现今研究成果执法人员相当清楚不同这群人中都菌株社则会性的差异和变化情况。

原始引自:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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