Sci Adv:并未证据支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的存在

2022-01-31 04:20:33 来源:
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摘录:在早期阶段,自然现象就开始了在不忽略病原体蛋白质DNA民间组织顺序的在此之前提从前使其DNA发挥不同的功能,而这就是通过给DNA蛋白上添加化学标示出来实现的。DNA甲基化是动器物的关键性一般说来遗传机制,其里面5-甲基胞嘧啶(5mc)是最常见的DNA标记之一。6mdA是病原体限制连续性标记系统的必需组成成分,目在此之前在动器物里面缺失已知的限制连续性标记系统。先在此之前有不少研究者美联社,6mdA也发挥效用于动器物里面,但并确实支持。

近日,在《科学研究进展》上的一项研究者里面,奥地利林雪平国立大学的研究者其他部门验证,动器物蛋白质里面发挥效用病原体一般说来遗传标示出很确实被污染源了,并且没有足够的证据来验证动器物里面发挥效用这种标记。

N6-甲基腺嘌呤(6mdA)是病原体里面广为的DNA标记,但除此以外在动器物DNA里面也得到了表征。然而,研究者其他部门说道,即使对来自相同动器物蛋白质类型的DNA来进行的6mdA定量和稀土元素测研究者也不完全一致。

为了全面阐释6mdA在动器物谱系规格里面的效用,研究者其他部门利用了体外将生命无聊T借助于(NTH)蛋白质发挥效用为TH蛋白质亚群的能力。但是,与先在此之前的研究者相反,他们断定TH发挥效用全过程里面6mdA的稀土元素没有全局忽略,并且注意到到发挥效用的T蛋白质里面的6mdA水准与未甲基化的全基因扩增DNA相同,这验证6mdA并未以可检验的水准发挥效用生命T蛋白质里面。

他们还分析了从六个生命蛋白质系里面分离出的DNA里面的6mdA,并鉴定出两个较强高于背景噪声水准的6mdA水准的蛋白质系。出乎意料的是,两种单独的293T蛋白质系培养器物较强不同的6mdA水准,这验证研究者其他部门注意到到的6mdA信号并非蛋白质类型本身固有的。确实,当他们全面看时,他们断定两条6mdA水准升高的蛋白质系被芽孢归入污染源,芽孢归入一种常见的病原体蛋白质培养器物里面富含6mdA的污染源器物。当他们用芽孢特异连续性抗生素Plasmocin处理蛋白质系时,6mdA信号降低为A阴连续性印证。

“我们认识到通过这些应用检验到的6mdA'信号'只是噪声。但是,由于一些复杂的应用问题,几种原理里面的背景噪声不是随机的,而是确实信号。”高级原作者Colm Nestor(维斯姆·内斯特)在一份声明里面说。

研究者其他部门分析了以在此之前通过DNA免疫沉淀生命基因组计划、质谱和单分子实时生命基因组计划在动器物蛋白质里面适配或检验6mdA的希望。人们断定每种原理都有局限连续性或缺陷,使一般说来遗传标示出的假阳连续性断定数万人很高,无论如何验证林雪平研究者其他部门认为不发挥效用这种现象的证据。

这组原作者说道:“我们验证,RNA和病原体污染源、病原体交叉反应连续性和其他应用限制的转化已所致6mdA在动器物DNA里面的间歇错误识别。随着DNA和RNA标记家族的促使激增,以及以在此之前未知标记的丰富连续性日渐罕见,即使用到多种有序原理,我们也强调了错误断定的确实连续性。我们允许用到标记和未标记的基因DNA准则作为将来对罕有DNA标记的研究者的最少允许,以及在用到在此之前更新一轮地验证病原体特异连续性。”

内斯特补足说,研究者其他部门在研究者十分罕见的现象时必须十分轻轻,选取用到哪种原理,并考虑他们是否真正在举例来说发挥效用的事器物。他说:“以在此之前我们可以无疑地说动器物里面不发挥效用6mdA。关于6mdA,如果研究者其他部门停止研究者根本不发挥效用的东西,则可以节省大量短时间和借贷,并且避免了很多令人满意的事情。”

原始说是:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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